Coursebooks 2016-2017

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Introduction to life sciences (for IC)

BIO-109

Lecturer(s) :

Zufferey Romain

Language:

Français

Résumé

Ce cours présente les principes fondamentaux à l'oeuvre dans les organismes vivants. Autant que possible, l'accent est mis sur les contributions de l'Informatique aux progrès des Sciences de la Vie.

Contenu

Le cours aborde la plupart des concepts fondamentaux des Sciences de la Vie. 

Les sujets développés parce qu'ils sont à l'interface avec l'informatique incluent :

- alignement des séquences, assemblage de séquences en génome

- matrice de distances et déduction d'un arbre phylogénétique

- détection de domaines transmembranaires et de signaux de localisation subcellulaire dans une séquence d'acides aminés.

- compositon en bases d'un génome entier, deuxième loi de parité de Chargaff, variations locales de la densité en CpG

- optimisation des codons dans diverses application pratiques.

Mots-clés

Bioinformatique, génome, séquençage, évolution, communication intercellulaires

Acquis de formation

A la fin de ce cours l'étudiant doit être capable de:

Compétences transversales

Travail attendu

En plus de la participations active aux cours et aux exercices, 4 heures de travail personnel sont attendues.

Méthode d'évaluation

Examen écrit durant la session d'été.

Encadrement

Office hours Oui
Assistants Oui
Forum électronique Non

Ressources

Polycopiés

Les dias du cours et les séries d'exercices sont mises à disposition du Moodle.

In the programs

Reference week

 MoTuWeThFr
8-9     
9-10     
10-11   CM013 
11-12   CM013 
12-13     
13-14    CM013
14-15    CM013
15-16 CM013   
16-17    
17-18     
18-19     
19-20     
20-21     
21-22     
 
      Lecture
      Exercise, TP
      Project, other

legend

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